疫情爆發一年多以來，已出現多種特別需要關注的變異株。最引人關注的變異株包括最先出現在英國肯特的Alpha、南非的Beta、巴西的Gamma，和印度的Delta。
而最近在我國最令人擔憂的Delta變異株，譜系學名為B.1.617.2，被認為是迄今為止傳播性最強的變種，比最初的病毒株及英國首次發現的Alpha變異株更易傳播。根據研究指出，Delta株的傳染性可能比Alpha株高50%。亦有其他的研究表明，該變異株有可能降低目前疫苗所產生之抗體的效果。
為了進一步確認患者體內的病毒是屬於那一種病毒株，NGS定序是必不可少的技術，然而以目前我國的Delta變異株的盛行率來看，若是直接將所有確診患者的檢體都投入定序，將會造成許多不必要的資源浪費。因此若是能在定序前先將檢體分類，將能更有效率的完成NGS定序並進行更進一步的研究。
MRXES CoVClear Mutation Panel從現行的4種VOC (Variants of Concerns)與部分VOI (Variants of Interests) 的變異位點中整理出了三個關鍵變異位點，藉由RT qPCR的方式偵測此三個關鍵突變，便可先初步的將檢體進行分類，依緩急程度進行更進一步的定序確認。
此三個關鍵變異位點分別為棘蛋白(Spike protein)上的N501Y、E484K與L452R。藉由這三個關鍵變異位點的結果，我們將可區分出Alpha variant、Beta/Gamma variant或是Delta variant等VOC，或是其他如Eta或Epsilon的VOI，如下圖。
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